主要職能：

（一）自然藏品管理。負責館藏自然標本、資料、模型等的管理；負責自然藏品庫房的管理和常態化巡查、維護。

（二）自然藏品保護。負責館藏自然標本等的常態化維護、修復；負責自然實驗室的管理和常態化巡查、維護。

（三）自然藏品研究。依托館藏自然標本開展南海動物、植物、生態、環境、地理、地質等方向的基礎科學研究，重點開展生物分類研究和生物多樣性保護等重大問題研究。

（四）自然展覽的策劃和實施。負責南海自然主題展覽策劃、實施和對外展覽交流合作。

（五）協同藏品征集部門開展南海和相關方向的藏品征集，以“最全種類、最多數量、做大規?！睘槟繕私ㄔO和完善南海自然藏品收藏體系。

（六）編制事業發展規劃，擬制相關工作標準，培養專業人才，完成上級交辦的其他工作。